Luận văn Nghiên cứu mô phỏng bài toán tương tác của Protein và Polymer bằng mô hình tối giản

Nội dung tài liệu: Luận văn Nghiên cứu mô phỏng bài toán tương tác của Protein và Polymer bằng mô hình tối giản

1. I H C QU C GIA HÀ N I I H C KHOA H C T NHIÊN --------------------- n NGHIÊN C U MÔ PH A PROTEIN VÀ POLYMER B NG MÔ HÌNH T I GI N LU C Hà N i 2017
2. I H C QU C GIA HÀ N I I H C KHOA H C T NHIÊN --------------------- n NGHIÊN C U MÔ PH A PROTEIN VÀ POLYMER B NG MÔ HÌNH T I GI N Chuyên ngành: V t lí lí thuy t và v t lí toán Mã s : 60 44 01 03 LU C NG D N KHOA H C: PGS.TS. NGUY N TH TOÀN Hà N i 2017
3. MỤC LỤC Mở đầu . 2 0.1 Lý do chọn đề tài .... 2 0.2 Phương pháp nghiên cứu 3 0.3 Bố cục luận văn .. 3 CHƯƠNG 1. Tổng quan về vi rút và vi rút HIV . 5 1.1 Tổng quan về vi rút . 5 1.1.1 Cấu trúc cơ bản của vi rút 5 1.1.2 Chu kỳ sống của vi rút . 6 1.2 Retro vi rút và vi rút HIV ... 7 1.2.1 Vi rút HIV 8 1.2.1.1 Hình dạng và Cấu trúc của vi rút .. 8 1.2.1.2 Vòng đời của vi rút HIV ... 9 CHƯƠNG 2. Phương trình Poisson-Boltzmann và lý thuyết tĩnh điện Debye-Huckel .. 12 2.1 Phương trình Poisson – Boltzmann 12 2.2 Phương trình Debye-Huckel ... 14 CHƯƠNG 3. Phương pháp mô phỏng Monte-Carlo . 18 3.1 Sơ lược về phương pháp mô phỏng Monte Carlo .. 18 3.2 Điều kiện cân bằng chi tiết . 19 3.3 Thuật toán Metropolis 20 CHƯƠNG 4. Mô phỏng tương tác của polymer tích điện và protein 23 4.1 Mô hình .. 23 4.2 Kết quả mô phỏng .. 26 4.3 So sánh với lý thuyết trường trung bình tự hợp . 30 Kết luận ... 32 Tài liệu tham khảo .. 34 Phụ Lục 37 ii